ต้นกำเนิดของกล้องจุลทรรศน์ได้รับว่าคนโบราณรู้ว่าการมองผ่านกระจกโค้งหรือแก้วทรงกลมที่มีน้ำทำสิ่งเล็ก ๆ ที่มองเห็นได้ด้วยการขยาย ในตอนนั้นทศวรรษแรกของศตวรรษที่สิบเจ็ดเริ่มทำการทดสอบกับเลนส์เพื่อให้ได้ภาพที่มีขนาดขยายใหญ่ขึ้น สำหรับสิ่งนี้พวกเขาใช้เครื่องมือแรกที่ทำด้วยเลนส์ที่ประสบความสำเร็จอย่างมาก " กล้องโทรทรรศน์ " ที่ใช้เป็นครั้งแรกในวัตถุประสงค์ทางดาราศาสตร์โดยกาลิเลโอในปี 1609
ในตอนต้นของศตวรรษที่ 20 การผลิตสิ่งนี้ได้รับการพัฒนาส่วนใหญ่ในเยอรมนีและในปีต่อ ๆ ไปความแตกต่างของเฟสการเรืองแสงโฮโลแกรมการรบกวนรังสีเอกซ์แสงอัลตราไวโอเลตวิธีการที่มีอิเล็กตรอนและโปรตอนได้รับการพัฒนา กล้องจุลทรรศน์คอมพิวเตอร์ยังได้รับการพัฒนาสำหรับการหาปริมาณการหาปริมาณและการวิเคราะห์สามมิติเครื่องมือเหล่านี้ได้เปิดหลายสาขาในพื้นที่ของกล้องจุลทรรศน์ตั้งแต่ปี 1660 จนถึงปัจจุบันกล้องจุลทรรศน์แบบใช้แสงเป็นเสาหลักในการศึกษาสิ่งที่มองไม่เห็น แม้ว่าความละเอียดจะเพิ่มขึ้นเมื่อเวลาผ่านไปตามการปรับปรุงคุณภาพของเลนส์และพลังในการขยาย
ในปีพ. ศ. 2473 โลกของกล้องจุลทรรศน์ได้ถูกขยายออกไปพร้อมกับการสร้างกล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนซึ่งความแตกต่างหลักของกล้องจุลทรรศน์แบบใช้แสงคือการเพิ่มขึ้นถึง 1,000 เท่าในระยะการขยายของวัสดุที่สังเกตได้พร้อมกับความสามารถในการแก้ปัญหาที่ดีกว่าทำให้เกิดความละเอียดและการขยายที่ดีขึ้นใน โลกด้วยกล้องจุลทรรศน์
กล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนพื้นฐานมีสองประเภทซึ่งทั้งคู่ถูกประดิษฐ์ขึ้นในเวลาเดียวกัน แต่มีหน้าที่แตกต่างกัน ได้แก่:
- กล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนแบบส่องผ่าน (MET): มีหน้าที่ในการฉายอิเล็กตรอนผ่านชั้นบาง ๆ ของวัสดุหรือเนื้อเยื่อที่จะสังเกตเห็นสะท้อนภาพบนหน้าจอฟอสฟอสเซนต์
- การสแกนด้วยกล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอน (SEM): สร้างภาพที่ให้ความรู้สึกเหมือนอยู่ในสามมิติ กล้องจุลทรรศน์นี้ใช้จุดสามหรือสองจุดที่อิเล็กตรอนของตัวอย่างมาถึงเพื่อสแกนพื้นผิวของตัวอย่างที่จะสังเกต
ผู้บุกเบิกกล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนในชีววิทยาส่วนใหญ่ยังมีชีวิตอยู่และที่สำคัญที่สุด ได้แก่Albert Claude, Earnest Fullam, Don Fawcett, Charles Leblond, John Luft, Daniel Pease, Keith Porter และ George Palade
