ไฮโดรเจนโซมเป็นออร์แกเนลล์ยูคาริโอตที่แปลกประหลาดและมีการเติบโตสูงที่สุดในโลก ออร์แกเนลล์นี้ตั้งอยู่ในไซโทพลาสซึมประกอบด้วยเนื้อเยื่อสองชั้นซึ่งเยื่อหุ้มชั้นในให้เพื่อแสดงลักษณะหงอน ไฮโดรเจนโซมวิวัฒนาการมาจากไมโทคอนเดรียโดยการรั่วไหลของลักษณะไมโตคอนเดรียของธาตุเช่นการสูญเสียจีโนม
ขนาดของออร์แกเนลล์เหล่านี้มีเส้นผ่านศูนย์กลางประมาณหนึ่งหน้าที่หลักของมันคือการเข้าไปแทรกแซงกระบวนการเมแทบอลิซึมของการหมักของสิ่งมีชีวิตบางชนิดที่เลือกให้ได้รับ ATP (โมเลกุลพลังงาน) ในสถานการณ์ที่ขาดออกซิเจน ควรสังเกตว่าฟังก์ชั่นนี้คล้ายกับการหายใจแบบไมโตคอนเดรียที่ดำเนินการโดยจุลินทรีย์ที่ไม่ใช้ออกซิเจน กรดไพรูวิกจะถูกย่อยสลายซึ่งเป็นโมเลกุลที่จำเป็นภายในเมแทบอลิซึมโดยตั้งอยู่ตรงกลางทางเดินเพื่อรับพลังงานจากสิ่งมีชีวิตแต่ละชนิด การสลายตัวของกรดไพรูวิกเป็นกระบวนการที่ดำเนินการโดยไฮโดรจิโนมที่ดูดซับ CO2, อะซิเตตซึ่งถูกขับออกไปในไซโทพลาซึมของเซลล์
ตอนนี้กระบวนการที่อธิบายไว้ข้างต้นสามารถอธิบายวิวัฒนาการของไมโตคอนเดรียได้อย่างไรก็ตามต้องพิจารณาอย่างรอบคอบเนื่องจากยังไม่ทราบแน่ชัดว่าไมโตคอนเดรียและไฮโดรเจนโซมเป็นออร์แกเนลล์ที่มีวิวัฒนาการร่วมกัน โดยเฉพาะอย่างยิ่งจำเป็นต้องตรวจสอบว่าไฮโดรเจนโซมมีโซ่ลำเลียงอิเล็กตรอนหรือไม่ สิ่งนี้มีความสำคัญอย่างยิ่งเนื่องจากการขนส่งไฮโดรเจนถูกทำลายภายในกระบวนการหายใจ ตอนนี้ถ้าออร์แกเนลล์ทั้งสองใช้โปรตีนที่คล้ายกันก็สามารถอนุมานได้ว่าพวกมันเชื่อมโยงกันและเมื่อเปรียบเทียบกับโปรตีนเหล่านี้กับแบคทีเรียที่คล้ายกันจะเป็นไปได้ที่จะทราบว่าไฮโดรเจนโซมนั้นมาจากไมโทคอนเดรียหรือในทางตรงกันข้ามพวกมันมีต้นกำเนิดที่เป็นอิสระ
สุดท้ายนี้ควรเสริมว่าการค้นพบออร์แกเนลล์เหล่านี้เกิดขึ้นในทศวรรษที่ 70
