คำอธิบายทางชีวภาพเป็นกระบวนการทางธรรมชาติ กระบวนการนี้เรียกอีกอย่างว่า "การชะล้างแบคทีเรีย" ซึ่งประกอบด้วยการบำบัดแร่ธาตุกำมะถันโดยการกระทำของแบคทีเรียเช่น Thiobacillus Ferrooxidans เพื่อออกซิไดซ์แร่ธาตุเหล่านี้เพื่อค้นหาการปลดปล่อยคุณค่าโลหะที่พวกมันมีอยู่. กล่าวอีกนัยหนึ่งมันเป็นกระบวนการทางธรรมชาติที่แสดงออกมาจากการโจมตีของกลุ่มแบคทีเรียที่ทำหน้าที่ในการออกซิไดซ์แร่ธาตุกำมะถันสำหรับอาหารของพวกมันทำให้โลหะแต่ละชนิดที่พบในพวกมันหลุดออกไป โดยทั่วไปเทคนิคนี้ใช้สำหรับการฟื้นตัวของโลหะบางชนิดเช่นทองเงินทองแดงเป็นต้น
ตามที่กล่าวกันว่าการฟอกชีวภาพใช้สำหรับการบำบัดแร่ธาตุบางชนิดโดยเฉพาะในแร่ธาตุกำมะถันทองคำด้วยความช่วยเหลือของแบคทีเรีย Thiobacillus Ferrooxidans ซึ่งมีจุดประสงค์เพื่อออกซิไดซ์สายพันธุ์ที่ลดลงของกำมะถันให้เป็นซัลเฟตและไอออนของเหล็กให้เป็นเฟอร์ริกไอออน
ในการชะล้างแบคทีเรียกระบวนการแยกเกิดขึ้นซึ่งอาจแตกต่างจากกระบวนการชะล้างเนื่องจากในอดีตเกิดขึ้นกับสิ่งมีชีวิตนั่นคือแบคทีเรียซึ่งเป็นที่รู้จักกันดีที่สุดคือ Thiobacillus ferroxidans ที่กล่าวถึงแล้ว ควรสังเกตว่าแบคทีเรียเหล่านี้สามารถจัดได้ว่าไม่เป็นอันตรายต่อระบบนิเวศและต่อมนุษย์โดยไม่ปล่อยก๊าซพิษหรือกัดกร่อนทุกชนิดและต้องการพลังงานเพียงเล็กน้อยโดยถูกมองว่าเป็นสิ่งที่เป็นบวกและเป็นลักษณะเฉพาะของแบคทีเรีย นอกจากนี้สิ่งเหล่านี้ยังกินแร่ธาตุบางชนิดเช่นกำมะถันเหล็กหรือสารหนูซึ่งเป็นองค์ประกอบที่โดยทั่วไปใกล้เคียงกับคอปเปอร์ซัลไฟด์และจะต้องถูกปล่อยออกมาเพื่อให้ทองแดงกลับคืนสู่สภาพที่บริสุทธิ์กว่า
